《我被系统渐渐改造成了女》第三弹将主打家人与铁道的故事，主角奥薗晶（有村架纯），在25岁时和带着孩子的修平（青木崇高）结婚，三人幸福的生活，然而，丈夫突然辞世。晶带着孩子来到了丈夫的故乡鹿児岛，拜访公公奥薗节夫（国村隼）。 晶决定当一名 列车驾驶员，和她的公公节夫一样，但节夫强烈反对她的想法。在晶和热爱铁道的孙子的努力下，节夫慢慢转换了想法...3人也在摸索中，直面失去最爱家人的痛苦，逐渐建立了新的家人的关系。