《樱花味少女仙m水晶棒》从呱呱坠地的那一刻起，吉米（杰克·吉伦哈尔 Jake Gyllenhaal 饰）就注定是一个不同寻常的男孩，他换上了极为罕见的重症联合免疫缺陷病，这也就意味着，他体内没有任何的免疫系统，任何对于正常人来说不值一提的细菌，都有可能在吉米的体内大量繁殖威胁到他的性命。 治疗这种疾病的唯一方法就是骨髓移植，但医生一直都没有寻找到能够和吉米相匹配的骨髓。于是，吉米只能终日生活在一个无菌的圆形气球里，他被人们称为“跑跑男孩”。吉米从小就生活在束缚和担心受怕之中，从未体会过生活的潇洒和肆意，随着时间的推移，吉米的性格越发内向和古怪。此时，一个美丽的女孩出现在了吉米的生命里，她的存在让吉米开始渴望走出泡泡，拥抱生活。