《激萌秘密导航》故事发生在并不算遥远的未来，人类在月球背面发现了一种岩石，它直接吸收太阳的能量，并在其中储存为气体氦3为了开发新型资源，一家名为“月球巨人”的公司在月亮上建立了基地，从事矿石的挖掘工作。而山姆·贝尔是这个月球基地唯一一个员工，陪伴他的只有一名机器人戈蒂（凯文·斯派西 配音）。在这孤独而漫长的3年，山姆靠着憧憬其后美满的地球生活撑了下来。但当合同即将期满之时，不寻常的事情发生了。一次事故中山姆救回了一个和自己长得一模一样的人类，他逐渐发现这背后隐藏的秘密。