《我被系统渐渐改造成了女》故事发生在唐朝，天授年间，国泰民安却也暗潮涌动，坊间多有诡事发生。年轻的狄仁杰在追查多人失踪案时无意中撞见活人变干尸的怪事。官府刻意隐瞒，皆因此事涉及武后和长孙无忌宫廷内斗，狄仁杰一意孤行誓要和发小，女保镖鱼兰青把真相揭露到底，却遭遇神秘刺客袭击，从而结识了身背两条人命债的嫌犯欧阳华，千丝万缕中他渐渐发现真相的背后还有真相，而欧阳华正是干尸一案的关键所在。与此同时，两派势力的爪牙也正斗得如火如荼，狄仁杰等人被卷入了漩涡中心，真相呼之欲出，但狄仁杰也危在旦夕……