《伊丁天堂暗夜精灵》故事围绕一对生活在日本八丈岛的母女展开。因为父亲的早早离世，母亲无奈成为了单亲妈妈，为了抚养小孩不得已兼职许多份工作，经常早出晚归。家里由姐姐照顾妹妹，母亲因此缺席了姐妹俩的童年成长时期。也因此造就了小女儿古怪的性格。由于儿时的经历，小女儿经常一言不发，尤其到了青春期，更是经常用恶劣的态度对待母亲，母亲决定用自己做菜的才华来改变这一切。青春期的女儿有意排斥可爱的事物，于是母亲便开始制作各种可爱的便当，让女儿在同学们面前“难堪出糗”。逐渐，母亲会把想要跟女儿说的话，在便当中传递出来，一来二去，母女间的互动逐渐增多。女儿开始通过便当聆听母亲的话语，逐渐承担起家务事。母亲也会在便当中给青春懵懂的女儿许多建议与指导。女儿面临着升学压力，想要实现儿时的梦想，与母亲共同经营一家餐厅。母亲却没有接受女儿的想法，母女的沟通出现了障碍。而这时，母亲被查出患病，也正是以此为契机，母女二人的隔阂逐渐消失。最终女儿选择坚持完成儿时的梦想，决定前往东京学习料理。